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PlantScreen高通量植物表型成像分析平台(传送带版)(一)

PlantScreen高通量植物表型成像分析平台(传送带版)(一)

PlantScreen高通量植物表型成像分析平台(传送带版)(一)
  • 发布时间: 2020-04-22 13:24
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PlantScreen高通量植物表型成像分析平台(传送带版)(一)  

 PlantScreen高通量植物表型成像分析平台由国际知名公司PSI公司研制生产,整合了LED植物智能培养、自动化控制系统、叶绿素荧光成像测量分析(可扩展多光谱荧光成像)、植物热成像分析、植物近红外成像分析、RGB真彩3D成像、高光谱成像、3D激光扫描成像分析、RhizoTron根系成像分析、自动条码识别管理、自动称重与浇灌系统等多项先进技术,以最优化的方式实现大量植物样品的全方位生理功能与形态结构自动成像分析,用于玉米、水稻、小麦、大豆及椰树等热带作物高通量表型成像分析测量、胁迫响应成像分析测量、生长分析测量、生态毒理学研究、性状识别、抗性筛选、作物遗传育种及植物生理生态分析研究等。

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PlantScreen技术特点:

1.模块式结构,配置灵活,可选配不同的功能模块,系统具备强大的可扩展性

2.全球领先的FluorCam叶绿素荧光成像技术,是作物生理生态功能性状的必备分析技术,配备独有的高灵敏度叶绿素荧光成像镜头,成像面积可选配35cm x 35cm或80cm x 80cm

3.可选配不同的表型成像分析模块:

1)叶绿素荧光成像单元,单幅成像面积35cm x 35cm或选配80cm x 80cm

2)多激发光、多光谱荧光成像模块,包括GFP等荧光蛋白成像、多光谱荧光成像分析等

3)3D RGB可见光成像分析单元,包括顶部和侧面两个高分辨率RGB镜头、0-360度旋转平台、光源灯

4)高光谱成像分析单元,有VNIR高光谱和SWIR高光谱供选配

5)红外热成像分析单元(标配顶部2维成像分析,可选配顶部与侧面3D成像分析),用于对植物干旱胁迫、气孔导度成像分析

6)3D激光扫描单元,用于对作物3D点云模型和形态结构分析,PSI专业技术,可以把叶绿素荧光成像、高光谱成像等投射到3D点云模型上进行3D分析、作物生长模型研究等

7)根系成像分析单元,RhizoTron根窗技术

8)NIR(近红外)成像单元,用于对植物水分状态分析,可选配3D近红外成像

9)自动称重与浇灌系统

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4.世界独创的智能LED光适应室,确保作物表型成像分析前稳定可比的光适应和暗适应

5.Shoot & Root Phenotyping全面分析植物表型

6.植物传送系统可根据客户需求定制、扩展

7.客户定制智能LED温室或作物生长室(选配),可模拟昼夜节律、多云天气等,传送系统可自动将植物从生长室中传送至光适应室然后进入成像室进行成像分析,并远程在线浏览分析

8.功能强大的操作系统及作物表型大数据平台,具备叶片跟踪监测功能、3D投射功能

9.PSI表型研究中心专家团队技术支持,每年在美国和欧洲分别组织举办一次世界植物表型研讨会

国际植物表型分析技术应用情况

作为全球第一家研制生产FluorCam植物叶绿素荧光成像系统的厂家,PSI公司在植物表型成像分析领域处于全球的技术前列,其FluorCam叶绿素荧光成像系统最先应用于植物表型分析研究,代表性论文如Celine Rousseau等(High throughput quantitative phenotyping of plant resistance using chlorophyll fluorescence image analysis, Plant Methods 2013)。在FluorCam技术基础上集成RGB 3D成像分析、高光谱成像分析、近红外成像分析、红外热成像分析及激光雷达扫描分析等先进技术的PlantScreen全自动高通量植物表型成像分析平台,成为目前世界上最先进的表型组学和作物遗传育种研究设备(应用案例另附)

系统配置与工作原理:

整套系统由自动化植物传送系统、光适应室、FluorCam叶绿素荧光成像、RGB成像、高光谱成像、根系成像、植物红外热成像、植物近红外成像、自动浇灌与称重系统、植物标识系统、控制系统及表型大数据平台等组成,温室或生长室内植物通过自动识别传送系统运送到光适应室内,然后进行必要的浇灌称重,再由传送带到成像室进行成像分析等,最后植物自动返回原位。系统服务器及数据分析平台在线采集分析并自动存储至数据库系统

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技术指标:

1. image.png光适应室:

·对作物成像分析前进行均一稳定的光适应或暗适应,以确保植物表型分析数据的可靠性

·智能冷白LED(6500K)+远红LED(735nm)光源,对植物无辐射升温效应,光强1000 μmoles /m2/s 0-100%(步进增幅1%)可调

·适应室内由通风系统保持空气交流通风

·具备植物高度激光监测系统,以根据高度调整成像高度等

·具备激光定位系统,以调整控制植物移动与成像程序(imaging protocols)的同步性

·垂直帘门确保与环境光线及成像系统的隔离

·具备IP监测镜头以始终保持对系统运行和植物移动状况的监视

·规格容量8盆/培养托

2.RGB 3D结构成像分析单元

a)2个高分辨率RGB镜头(顶部和侧面),新一代CMOS彩色传感器,分辨率12.8Mpix(4096x3000),像素大小3.45µm

b)成像高度可客户定义或设置,范围0-1050mm,精确度3mm

c)360度旋转平台、LED均一光源照明

d)数据传输:千兆以太网

e)测量参数:叶面积、植物紧实度/紧密度、叶片周长、偏心率、叶圆度、叶宽指数、植物圆直径、凸包面积、植物质心、生长高度、植物最大高度和宽度、相对生长速率等

f)可进行颜色分割分析、植物适合度评价、实验生长期叶面积动态变化比较分析、绿度指数、颜色分级分析(健康绿色、亮绿色、暗绿色、其他颜色)等表型参数

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3.FluorCam叶绿素荧光成像单元

a)成像面积:35×35cm或选配80x80cm

b)橙色620nm LED脉冲调制测量光源

c)双色光化学光,橙色620nm LED和冷白LED光源

d)冷白LED饱和光闪,最大光强4000 µmol(photons)/m².s

e)735nm LED红外光源用于测量Fo’等

f)可选配蓝色光源与7位滤波轮,用于GFP稳态荧光测量

g)高灵敏度叶绿素荧光成像专业CCD传感器,1.4M分辨率, A/D 16比特,具备视频模式和快照模式

h)测量参数:FoFmFvFo'Fm'Fv'FtFv/FmFv'/Fm'PhiPSIINPQqNqPRfdETR等,用于分析植物光合效率、适合度、生物与非生物胁迫及作物抗性、恢复力等

i)Fv/Fm、Kautsky诱导效应、荧光淬灭分析等完备自动化测量程序(protocols)与测量参数,如Fv/Fm程序测量时间仅需10s

j)叶绿素荧光数据在线分析,包括柱状图、测量参数图、数据表格等,具备自定义图像分割等功能

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4. 多光谱荧光成像模块

·不仅可以运行PAM叶绿素荧光成像,还可以进行GFP/YFP等荧光蛋白成像、多光谱荧光成像

·9种LED激发光源:UV(365nm)、青色光源(440nm)、蓝色光源(470nm)、绿色光源(530nm)、琥珀色光源(590nm)、橙色光源(630nm)、深红色光源(660nm)、远红光源(730nm)及冷白光源(5700K)

·可成像分析多酚类(黄酮醇类、花青素等)、N素指数等

·分辨率1360x1024像素,binning 2x2、680x512像素

5. 红外热成像单元

·成像传感器:焦平面阵列微测热辐射计,分辨率 640×480 像素,灵敏度30mK(0.03°C),波段7.5-13μm

·可选配高分辨率红外热成像,分辨率可达1024x768像素,灵敏度20mK(0.02°C)

·温度范围 -20 – 120℃,分辨率<0.03℃@30℃/30mK

·专用成像光源:冷白LED光源板,用于给测量植物提供稳定热环境,6500K,最大光强 1000 µmol(photons)/m².s,0-100%可调

·具备温度动态Protocols,光照强度、持续时间、热成像分布数据同步获取,以研究分析植物温度分布动态等

·具备温度参考传感器(reference sensors)

·测量参数:植物每一点的实际温度,植物表面温度分布图

·专业分析软件用于数据获取、分析、存储等

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6. NIR成像分析单元(选配):

·用于成像监测分析植物水分状态分布,具备假彩调色板,可以方便对比分析,快速监测脱水植物,因而可以监测评估干旱胁迫条件下植物水分的动态变化响应及水分利用效率等

·可与RGB成像形态结构参数及FluorCam光合效率参数进行相关分析等;可完整记录追溯干旱过程与复水过程的动态响应等

·通过测量水分吸收光谱和940nm参考光谱,有效避免环境光及阴影效应

·InGaAs传感器,有效芯片大小9.6x7.7mm,波段范围900-1700nm,分辨率638x510像素,帧频118fps,A/D 14比特

·可选配顶部与侧面双镜头三维成像分析

·选配根系成像分析单元,以对根系进行近红外成像分析

7. 可见光-近红外高光谱成像单元

·          image.png成像波长范围:400-950nm(或350-900nm)

·成像传感器:推扫式线性扫描传感器,配备专用扫描光源

·像素色散:0.28nm/pixel

·光谱分辨率0.8nm FWHM

·光谱带数(波段数):1920个波段

·空间分辨率:1000

·入射狭缝宽度:25μm

·帧频:45fps

·CMOS检测器,光圈F/2.0,GigE网络接口

·自动参考校准,线性扫描,高度可调

·测量参数:每个波段的反射光谱成像图及全光谱曲线,并可自动计算以下植被指数:归一化指数NDVI、简单比值指数SR、改进的叶绿素吸收反射指数MCARI、改进的叶绿素吸收反射指数1MCARI1、最优化土壤调整植被指数OSAVI、绿度指数G、转换类胡罗卜素指数TCARI、三角植被指数TVI、ZMI指数、简单比值色素指数SRPI、归一化脱镁作用指数NPQI、光化学植被反射指数PRI、归一化叶绿素指数NPCI、Carter指数、Lichtenthaler指数、SIPI指数、Gitelson-Merzlyak指数、花青素反射指数等等

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8. 短波红外高光谱成像单元

·成像波长范围:900-1700nm

·成像传感器:推扫式线性扫描传感器,配备专用扫描光源

·光谱分辨率:2nm(FWHM)

·光谱带数:510个波段

·空间分辨率636

·测量参数:每个波段的反射光谱成像图及全光谱曲线,无损测量植物整体及不同部位水分含量变化(右图中蓝色越深含水量越高)

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9. 3D激光扫描单元:

·顶部与侧面激光扫描,660nm激光,用于植物精确3D模型构建,分辨率低于1mm

·顶部扫描距离60cm,客户定义侧面扫描距离

·3D点云模型,RGB成像、叶绿素荧光成像数据等可与3D模型叠加分析

·植物结构、生物量、叶片数量、叶面积、叶片倾斜角度、植物高度等结构形态参数

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